Hai trăm năm trước, ô nhiễm và khai thác lõi hành tinh đã đánh thức Gaia Core, ý thức của cả tinh cầu, sinh ra Sentinel Beasts để chống lại loài người. Tàn dư nhân loại ẩn náu trên pháo đài bay The Ark, dưới quyền giáo hội của Hồng y Ignatius. Trong khi cơ giáp săn lùng Sentinel Beasts, The Ark vẫn âm thầm hút cạn năng lượng lõi. Những người sở hữu Resonance Power bị gọi là Divine-Touched và bị hiến tế qua nhiều thế hệ.
